应交税费为负数，这通常意味着企业已经多交了税费，或者相关的税费没有经过计提就直接进行了交税处理。如果明细科目月末余额为负数，就需要进行深入分析。例如，增值税留抵税额的二级科目未交增值税就是借方余额。
通常情况下，企业的税金会先进行计提，然后再缴纳。少部分情况下，企业会先预缴税款，然后再进行计提。以附加税为例，其账务处理过程如下：
借：税金及税费 贷：应交税费—应交城建税
当企业缴纳税款时，会进行以下账务处理：
借：应交税费—应交城建税 贷：银行存款
如果企业在完成缴纳分录后才进行计提，那么计提后的金额就会形成负数。此外，如果企业预先缴纳了增值税或附加税，也可能导致应交税费为负数。
借：应交税费—未交增值税 贷：银行存款
如果企业在没有计提的情况下直接预缴了增值税，那么应交税费就会形成负数。
补充说明一下一般纳税人的账务处理。在购买库存商品时，企业会进行以下账务处理：
借：库存商品 应交税费—应交增值税（进项税额） 贷：银行存款
在销售商品时，企业会进行以下账务处理：
借：银行存款 贷：主营业务收入 应交税费—应交增值税（销项税额）
同时，企业需要结转销售成本，进行以下账务处理：
借：主营业务成本 贷：库存商品
在月末，企业需要将相关收入和成本结转，进行以下账务处理：
借：主营业务收入 贷：本年利润 借：本年利润 贷：主营业务成本
如果月底进项大于销项，企业可以不做分录。而如果月底销项大于进项，说明企业需要缴税，需要进行以下结转分录：
借：应交税费—应交增值税（转出未交增值税） 贷：应交税费—未交增值税
次月，企业需要缴纳税款，进行以下账务处理：
借：应交税费—未交增值税 贷：银行存款