如果丢失的部分是可以自制的原始凭证，那么可以重新制作原始凭证，并从系统中再次打印整理好记账凭证。这种情况下是公司内部的管理责任问题。
如果丢失的部分是发票记账联，那么可以根据公司的存根联进行复印，并从系统中再次打印整理好记账凭证。
如果公司丢失的是外部凭证，比如发票，在这种情况下，可以根据系统所查询核算信息来联系对方单位，重新复印一份作为原始凭据，并再次打印整理好记账凭证。公司记账凭证丢失时，可以根据会计系统逐笔进行查核比对。如果是银行单据丢失的，可以联系相应的银行补打银行回单。
总之，对于丢失的记账凭证，公司应该根据具体情况采取相应的措施。无论是内部凭证还是外部凭证，都需要及时处理，以确保财务记录的准确性和完整性。