土地增值税应纳税额的计算方法为：首先，需要确定增值额，即房屋销售收入减去扣除项目金额。然后，将增值额乘以适用税率，再减去扣除项目金额乘以速算扣除系数，即可得到土地增值税应纳税额。
举个例子来说明，假设实现的房屋销售收入为1000万，扣除项目合计金额为60万。首先计算增值率，即（1000万-60万）/1000万=40%。根据适用税率表，40%的增值率对应的适用税率为30%。同时，速算扣除系数为0。
接下来，根据公式进行计算。将增值额40万乘以适用税率30%，得到12万。**，再减去扣除项目金额60万乘以速算扣除系数0，得到**的土地增值税应纳税额为12万。
需要注意的是，以上计算仅为示例，实际计算中应根据具体情况确定适用税率和速算扣除系数。此外，土地增值税的计算还可能涉及到其他因素，如房屋面积、土地使用权等，因此在具体操作中还需结合相关法律法规和税务政策进行综合考虑。