由于工厂与承建公司合作失败，导致预付账款无法收回，这应被视为坏账进行计提和结转。

首先进行坏账准备的计提，

借：信用减值准备，

贷：坏账准备，

然后对预付账款进行冲销，

借：坏账准备，

贷：预付账款。