小规模纳税人附加税申报具体操作方法如下：企业先由登办税人员陆电子税务局，在界面点击税费申报及缴纳，点击填写申报表，核对税款所属期限，填写当月缴纳的增值税和其他流转税的金额，填写经办人及身份证号码，点击申报，申报后点击扣款，然后点击确定即可。