查账征收没有发票的成本是不允许企业在税前扣除，应该在申报缴纳企业所得税时，做纳税调增处理，这样会导致企业缴纳所得税时税率变高。如果企业不具备完整的财务制度，不能准确核算成本费用支出，建议向税务机关申请为核定征收企业所得税。