应付职工薪酬科目年末是可以有余额的，没有规定应付职工薪酬科目年末必须做到无余额。

计提工资的时候账务处理是，

借：管理费用等科目，

贷：应付职工薪酬—工资。

发放的时候账务处理是，

借：应付职工薪酬—工资，

贷：银行存款等科目。

有工资或者福利费没有支付完，那么应付职工薪酬科目年末就会有余额的。