企业的垃圾清运费根据企业的业务不同计入到不同的科目，比如建筑工程工程企业在进行工程施工时产生的垃圾清运费，计入到工程施工—合同成本—其他直接费用科目。如果是工业企业生产车间的垃圾清运费，可以计入到制造费用—清理费科目，如果是一般的商贸企业，则可以计入到管理费用科目。