实缴时间不能超过申请时间是指企业或者纳税人实际缴费的时间不能超过企业申请的范围，比如，企业申请缴纳税费的时间是7月15日之前，那么企业实际缴纳税费的时间就不能超过7月15日，而应该在这之前完成缴费。