根据与分包企业确认的结算通知单，首先根据合同协议约定扣减预付账款，其差额确认应付的工程款，

借：工程施工—合同成本—分包工程费用，

贷：应付账款—应付分包款—**分包单位，

预付账款—预付分包款—**分包单位。

支付已经办理结算的款项时，

借：应付账款—应付分包款（扣除代扣税款），

贷：银行存款。