花呗分期商家也要负担手续费的，花呗手续费是订单交易金额的1%，而且支付宝会自动扣取的。花呗分期，是由蚂蚁花呗提供授信，用于在购买商品时享受分期付款的服务，先购物，慢慢还，拥有所爱，无需等待。花呗分期产品还有以下特点：

(1)0首付，支持3、6、9期付款;

(2)3期享0手续费;

(3)还款超方便。