化学分析工程师考试主要考察考生的化学分析理论知识、实践技能和综合素质。考试内容分为三部分：
1. 理论基础知识包括化学分析基本概念、量化性和定性性分析及方法、物质性质测定及测定精度、分析仪器仪表及原理、生物分析等。
2. 实践技能包括样品处理、样品前处理、分析方法确定、仪器使用、实验安全、质控、数据处理等。
3. 综合素质包括技术管理能力、统计分析能力等。
此外，比较新兴的化学分析工程师考试还要考察现代计算机技术的应用，以及一些比较新的分析技术，如质谱法（MS）、核磁共振法（NMR）、原子吸收光谱（**S）、紫外-可见光谱（UV-Vis）、等离子体焦磷光谱（ICP-OES）、等离子体质谱（ICP-MS）等，以及计算机辅助分析等技术。