当发票联和抵扣联丢失时，企业可以采取一系列措施来处理此类情况。首先，企业应立即以书面形式发出损失说明。说明书应清楚表明发票丢失的时间、数量和发票号码等信息；发票丢失的原因；处理发票丢失的管理措施。
其次，企业应积极主动向税务机关及时备案，报告发票被抢和丢失的情况，并申请补开（复印）发票。同时，企业还应做好文档证明，保存相关凭证，以便税务机关在核实后进行审核。
**，企业还可以建立良好的内部管理机制，加强对发票的账务管理和保管，以减少发票的损失，确保税务业务的正常开展。此外，在发票安全管理方面，企业应注意上述处理损失的措施外，还可以采取一些措施来加强发票的安全管理。例如：控制发票与发票联相结合发放，实行发票登记管理，加强对发票管理以及报销流程的审核等。