当纳税人发现税款多交时，可以采取以下步骤进行更正申报并申请退回多交的税款。首先，纳税人需要准备完税证明，这是证明纳税人已经缴纳了税款的重要文件。
在账务处理方面，当纳税人多交税款时，需要进行相应的会计分录。具体来说，借方应计入应交税费下的某某税款科目，贷方则记入银行存款科目。这样的处理方式可以准确地记录纳税人多交的税款金额。
而当纳税人申请退回多交的税款时，账务处理会有所不同。此时，借方应计入银行存款科目，贷方则记入应交税费下的某某税款科目。这样的处理方式可以确保纳税人能够成功退回多交的税款。
需要注意的是，在进行更正申报和退回多交税款的过程中，纳税人应遵循相关的法律法规和税务部门的规定。同时，纳税人还应保持及时沟通与税务部门的沟通，确保申报和退款过程的顺利进行。
总之，当纳税人发现税款多交时，可以通过准备完税证明并进行相应的账务处理来更正申报并申请退回多交的税款。这一过程需要遵守相关法规和规定，并与税务部门保持良好的沟通，以确保申报和退款的顺利进行。