工程结算是施工企业根据承包合同和已完成的工程量，向建设单位办理工程价款清算的经济文件。它属于成本类科目。如果工程施工科目余额大于工程结算科目余额，会计入资产负债表的存货项目；反之，如果工程施工科目余额小于工程结算科目余额，则会计入资产负债表的预收账款项目。
对于自建厂房的账务处理，首先需要购入为工程准备的物资。这需要借记工程物资，贷记银行存款。接着，工程领用物资时，借记在建工程—厂房，贷记工程物资。剩余的工程物资可以转作企业生产用原材料，借记原材料，应交税费—应交增值税（进项税额），贷记工程物资。
工程领用生产用原材料时，借记在建工程—厂房，贷记原材料，应交税费—应交增值税（进项税额转出）。分配工程人员工资时，借记在建工程—厂房，贷记应付职工薪酬。辅助生产车间为工程提供的劳务支出，借记在建工程—厂房，贷记生产成本—辅助生产成本。
**，当工程达到预定可使用状态并交付使用时，借记固定资产，贷记在建工程—厂房。这样，自建厂房的账务处理就完成了。