小规模企业开票征收率为1%的操作步骤如下：
首先，开具发票时与开具3%征收率发票的方式相同。只需在税率栏次中选择1%即可。
其次，在办理增值税纳税申报时，对于减按1%征收率征收增值税的销售额，应当填写在《增值税纳税申报表（小规模纳税人适用）》中的“应征增值税不含税销售额（3%征收率）”相应栏次。
另外，需要计算并填写对应减征的增值税应纳税额。根据销售额的2%计算，将其填写在《增值税纳税申报表（小规模纳税人适用）》的“本期应纳税额减征额”以及《增值税减免税申报明细表》减税项目相应栏次。
通过以上操作，小规模企业可以正确开具1%征收率的发票，并在纳税申报表中填写相关数据，确保税务申报的准确性和合规性。