通过自然人电子税务局(扣缴端)进行，扣缴义务人登录自然人电子税务局(扣缴端)，左侧导航栏点击进入"退付手续费核对"模块，软件会自动下载结报单，先核对"退付手续费"核对清册，核对无误的，确认结报单，税务机关以扣缴义务人确认的结报单，作为退付手续费的依据，点击提交进入退税流程，退税未到账之前可以再次进入点击撤销申请，撤销退付手续费核对。